El programa de mejoramiento genético de arroz (PMGA) de INIA lidera desde hace décadas la oferta varietal a nivel nacional, mediante el desarrollo de variedades de alto rendimiento, calidad molinera, y resistencia genética a enfermedades fúngicas. Es necesario aumentar la eficiencia de la ganancia genética, y la herramienta moderna de mayor adopción para ello es la selección genómica (SG), que permite acortar el ciclo de mejoramiento mediante la selección de parentales en etapas tempranas, y acelerar el desarrollo de nuevas líneas al evaluar más variabilidad usando menos tiempo y recursos. También optimiza la ganancia genética para más de una característica objetivo. Implementar SG en programas públicos requiere genotipado de bajo costo y rápida respuesta, y la evaluación empírica de su desempeño. En nuestro país, se ha avanzado en el genotipado genómico de germoplasma avanzado de arroz, y se ha evaluado por validación cruzada la precisión de selección por rendimiento en arroz. También se ha estimado la ganancia genética por recurso invertidos en el programa, para selección fenotípica y asistida. Este proyecto tiene como objetivo principal aplicar SG multi caracter en el PMGA usando genotipado de bajo costo, para selección de cruzamientos y para desarrollo de líneas, y evaluar su desempeño en forma empírica contrastando los valores predichos con los datos de ensayos multiambientales y estimando la ganancia genética por unidad de recurso invertida. Esto permitirá generar nuevo conocimiento sobre los parámetros genéticos relevantes para optimizar la ganancia genética alcanzable por unidad de costo, y potenciará la integración de rutina de SG en el PMGA, contribuyendo a una mayor eficiencia en su aporte al sector productivo.