Abundan las evidencias de que una inversión bien dirigida y ejecutada en investigación, desarrollo e innovación (IDi) agropecuaria pública de América Latina y el Caribe (ALC) puede tener un impacto beneficioso en la economía, la seguridad alimentaria y la reducción de la pobreza de un país (Stads et al., 2016). Pero, para lograrlo, las instituciones de IDi de ALC deben superar ciertos retos y combinarlo con un mayor apoyo a sus actividades en los países. Desde comienzos de este siglo, muchas naciones de ALC han hecho esfuerzos para adaptar sus sistemas nacionales de IDi a los nuevos escenarios, con una mayor capacidad de investigación, más investigadores, mejor nivel de formación académica, modelos de gobernanza y gestión renovados, y procesos más participativos de investigación, de redes y de plataformas público-privadas (Gianoni y Trigo, 2021). Los autores coinciden en que disponer de sistemas nacionales de investigación agropecuaria bien desarrollados, con niveles adecuados de inversión y de personal capacitado, son requisitos indispensables para el crecimiento de la productividad agropecuaria, la seguridad alimentaria y la reducción de la pobreza. Serán necesarias transformaciones a nivel de las instituciones de IDi agropecuarias de ALC para acompañar los nuevos desafíos de la región. Los retos implican preguntarse hacia que modelo institucional hay que transformarlas y cómo llevar a cabo dicha transformación. Basándose en su experiencia, los autores ofrecen recomendaciones prácticas para hacedores de políticas públicas y para otros sectores interesados en acelerar las mejoras de las instituciones de IDi agropecuaria de ALC, para así adaptarlas a los nuevos desafíos.