ABSTRACT. - Sustainable development of food production requires more productive, profitable, and resource-efficient farming systems. Economic efficiency depends on commercial yield, but also on the efficient use of inputs, their price, and the sale price of products; it is also related to farming system characteristics. This study aimed to assess resource endowment and structural characteristics of greenhouse tomato farms and how they affect the economic efficiency of tomato crop, delving into the analysis of the main causes of its variability. This study included 23 representative farms in south Uruguay and 110 tomato crops (two to three per farm) during 2014/2015 and 2015/2016 seasons. We found high variability in commercial yields, product quality, sale prices according to harvest time, and production costs. This resulted in significant variability in net margins among crops, from negative values to a maximum of USD 16.2 m-2. Four groups were distinguished according to farm characteristics. Large-scale farms had higher economic efficiency in tomato crops, however, farm scale group was not among the main factors responsible for crop net margin variability. The main cause of net margin variability in 2014/2015 and 2015/2016 was gross income variability. Yield and sale price explained net margin differences for all gross income levels. However, the price was more relevant within the group with higher gross income and yield within the lower gross income group. Production costs were only ranked in the group of higher gross income. RESUMEN.- El desarrollo sustentable de la producción de alimentos requiere sistemas prediales más productivos y eficientes en el uso de los recursos. El objetivo de este trabajo fue conocer las características estructurales y los recursos disponibles en los predios que realizan producción de tomate bajo invernadero y cómo se vinculan con la eficiencia económica del cultivo, profundizando en el análisis de las principales causas de su variabilidad. Se trabajó sobre una muestra de 23 predios representativos de la zona sur de Uruguay y 110 cultivos de tomate (dos a tres por predio) durante las zafras 2014/2015 y 2015/2016. Se encontró una alta variabilidad en los rendimientos comerciales, calidades, precios de venta de acuerdo con la época de cosecha y costos. Esto resultó en una importante variabilidad en los márgenes netos, desde valores negativos hasta un máximo de USD16,2 m-2. Se distinguieron cuatro grupos de predios de acuerdo con las características funcionales y estructurales de los mismos. Sin embargo, el grupo predial no estuvo entre los principales responsables de la variabilidad en el margen neto del cultivo. La principal causa de estas diferencias en 2014/2015 y 2015/2016 fue la variabilidad de ingresos brutos por superficie. La productividad, calidad y el precio de venta aparecieron explicando las diferencias de margen neto. El precio fue más relevante dentro del grupo de mayor ingreso bruto y el rendimiento, en el grupo de menor ingreso bruto. Los costos de producción solo quedaron jerarquizados para los de mayor ingreso bruto. RESUMO. - O desenvolvimento sustentável da produção de alimentos requer sistemas agrários mais produtivos e eficientes no uso de recursos. O objetivo deste trabalho foi conhecer as características estruturais e os recursos disponíveis nas fazendas que produzem tomate em casa de vegetação e como eles estão relacionados à eficiência econômica da cultura, aprofundando-se na análise das principais causas de sua variabilidade. Trabalhamos em uma amostra de 23 fazendas representativas no sul do Uruguai e em 110 lavouras de tomate (2 a 3 por fazenda) durante as safras 2014/15 e 2015/16. Foi encontrada alta variabilidade nos rendimentos comerciais, qualidades, preços de venda de acordo com a safra e os custos. Isso resultou em uma variabilidade significativa nas margens líquidas, de valores negativos a um máximo de US $ 16,2 m-2. Quatro grupos de fazendas foram distinguidos de acordo com suas características funcionais e estruturais. No entanto, o grupo agrícola não estava entre os principais responsáveis pela variabilidade na margem líquida da safra. A principal causa dessas diferenças em 2014/15 e 2015/16 foi a variabilidade da receita bruta por área. Produtividade, qualidade e preço de venda apareceram explicando as diferenças na margem líquida. O preço foi mais relevante no grupo com a maior receita bruta e o desempenho no grupo com a menor receita bruta. Os custos de produção foram hierarquizados apenas para aqueles com maior receita bruta.