El Fondo de Promoción de Tecnología Agropecuaria (F.P.T.A.) fue creado por el artículo 18 de la Ley 16.065. El mismo expresa textualmente  “Créase el Fondo de Promoción de Tecnología Agropecuaria con destino a financiar proyectos especiales de investigación tecnológica relativos al sector agropecuario, no previstos en los planes del Instituto”

Al llamado 2005 publicado en Diciembre de 2005, se presentaron 158 propuestas de investigación por parte de un amplio espectro de instituciones  nacionales e, inclusive, extranjeras.

El proceso de selección de proyectos se realizó en  varias etapas, destacándose la evaluación Técnico Científica, realizada por INTA de Argentina y EMBRAPA de Brasil.  Debe destacarse que por primera vez en la historia de los Llamados FPTA, se estableció por parte de INIA la aplicación de la evaluación de la calidad Científico - Técnica  para todas las propuestas recibidas con carácter eliminatorio. Este proceso aseguró que los proyectos evaluados, contaran con un buen standard de calidad científico –técnico.   

Finalmente se aprobaron 53 propuestas de investigación por un monto total de aproximadamente US$ 4:2 millones.

El día 20 de diciembre se firmaron los Convenios de Vinculación Tecnológica, que regularán la ejecución de los proyectos aprobados.