Mycobacterium avium sp. paratuberculosis (MAP) es el agente causal de la paratuberculosis o enfermedad de Johne, una enfermedad infecciosa entérica que afecta principalmente a los rodeos lecheros. Tiene una distribución mundial, es altamente prevalente y genera grandes pérdidas económicas asociadas a un detrimento general de la salud del animal. Los animales afectados experimentan disminución de la producción de leche, pérdida de masa corporal, disminución de la fertilidad y mayor incidencia de otras enfermedades. A pesar de su gran ubicuidad y las pérdidas económicas que se asocian a la incidencia de la enfermedad, el estudio genómico de este patógeno es reciente. En este proyecto se propone en primer lugar, generar un banco de cepas de MAP aislados de rodeos de nuestro país y obtener las secuencias de los genomas completos de estos aislamientos. El análisis de dichos genomas nos permitirá identificar y caracterizar los linajes de MAP circulantes, determinar relaciones filogenéticas y poner a prueba diferentes hipótesis sobre la historia demográfica y evolutiva de MAP.