Este es el primer proyecto de visión transversal e institucional que plantea la incorporación de una disciplina, el mejoramiento molecular, de manera rutinaria y coordinada en todos los programas de mejoramiento genético de INIA (arroz, citrus, especies hortícolas, especies frutícolas, especies forrajeras, trigo, cebada, soja y eucaliptus). De esta forma, se espera incrementar la ganancia genética en todos ellos optimizando el uso de los recursos humanos y financieros del instituto. En el caso de arroz se seleccionará para el gen de inundación Sub1, adaptación a siembra temprana, desarrollo de híbridos, predicción genómica de tolerancia a enfermedades de tallo y vaina y resistencia a herbicidas. En trigo se validarán de marcadores para diferentes caracteres y uso de marcadores asociados a enfermedades, morfología y fenología. En cebada se validarán y usaran marcadores para respuesta al fotoperíodo y resistencia a enfermedades. En soja se usarán marcadores para genes de resistencia a roya y predicción genómica de contenido de proteína en grano. En especies hortícolas se ajustaran y validarán de marcadores moleculares de la bibliografía y desarrollar nuevos, implementando la tecnología de High Resolution Melting (HRM), para genes de resistencia y de calidad de fruta. En citrus se desarrollarán, validarán y/o usarán marcadores para autoincompatibilidad, tolerancia a Alternaria, mono/poliembrionía y presencia del gen Ruby. Para vid se usarán marcadores SSR para la incorporación de genes de resistencia a mildiu y en caso de especie de hoja caduca marcadores para identificación varietal e identificación de alelos de incompatibilidad. En el programa forestal se determinará el grado de diversidad genética presente en las poblaciones fundadoras e E. smithii instaladas por el INIA. En el mejoramiento de forrajeras se usaran marcadores para la identificación de origen paterno de las policruzas, en lotus se validarán marcadores para tolerancia a sequía, y en avena se seleccionará para fotoperíodo y vernalización. Mas allá de los avances puntuales en ganancia genética de los diferentes programas, el enfoque transversal permitíra optimizar el uso de los recursos, mediante uso compartido de instalaciones y equipamiento y una dinámica de discusiones, seminarios y reuniones que generará sinergia entre investigadores y personal de apoyo involucrado en diferentes aspectos del mejoramiento genético. Este proyecto permitirá incrementar la masa crítica en temas vinculados al mejoramiento molecular en INIA.