La papa (Solanum tuberosum) es el tercer cultivo más importante. Sus niveles de diversidad se han reducido debido a la domesticación y la selección, aunque existen recursos genéticos diversos en su pool génico terciario. Uruguay es centro de diversidad de S. commersonii, que posee resistencia a Ralstonia solanacearum (agente de marchitez bacteriana, segunda enfermedad en la papa), tolerancia a frío y sequía, gran diversidad genética y adaptabilidad. Ha sido usada por INIA en un avanzado programa de mejoramiento por introgresión para incorporar resistencia a marchitez bacteriana, produciendo híbridos interespecífos y retrocruzas derivadas, junto con líneas de mejoramiento con otras características agronómicas de interés. Para asistir a este programa de mejoramiento y acelerar sus productos, este proyecto evaluará la introgresión del genoma de S. commersonii y la recombinación homeóloga de sus cromosomas con los de S. tuberosum en retrocruzas avanzadas, mediante hibridación genómica in situ (GISH). También se estudiará la correlación entre los mapas genéticos y citogenéticos de S. tuberosum y S. commersonii, y se evaluará la sintenia entre ellos, usando hibridación in situ fluorescente con BACs (BAC-FISH). Finalmente, se obtendrá un borrador del genoma completo de S. commersonii, que permitirá realizar mapeo comparativo con el genoma de referencia de S. tuberosum por análisis bioinformáticos, para evaluar sintenia y detectar genes ortólogos y especie-específicos. La información generada aquí, asistirá la toma de decisiones en el proceso de producción de germoplasma avanzado y será de utilidad para otros programas que usen a S. commersonii como recurso genético en el mejoramiento de la papa.