La secuenciación de genomas de varias especies ha permitido identificar polimorfismos de nucleótido simple (SNP), cuya abundancia y distribución en los genomas, conjuntamente con las nuevas herramientas moleculares capaces de genotipar miles de SNP a la vez, han hecho a estos marcadores la herramienta por excelencia para los estudios de asociación y selección genómica.